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顿狈础的分离和提取中一般要用到离心机叁次：

第一次离心是在细胞破碎后，目的是除去溶液中的固体杂质。

第二次离心是在第一次离心的上清中加入苯酚/氯仿/异戊醇溶液以后，目的是将顿狈础和蛋白质等杂质分离。

第叁次离心是在第二次离心的上清中加入氯仿/异戊醇溶液之后，目的是进一步纯化顿狈础、并除去上一步中引入的苯酚。

    虽然冷冻离心机在冷冻或是低温条件下会对细胞造成DNA损伤，影响结果。但冷冻条件下能够很好地把核酸DNA沉淀下来，若采用常温离心机，必需要提高转数才能在相同时间内获得相当的沉淀量。温度不合适情况下的离心分离会加速DNA降解或者断裂。